研究领域主要包括三方面：环境微生物组学及应用、废弃物生物转化和废弃物资源化产品及应用。团队研究方向及人员组成如图1所示。

表1.团队研究方向及人员组成

一、环境微生物组学及应用  

1. 微生物宏基因组平台
2. 耐盐菌的筛选及其菌剂的研发 
3. 高温菌的筛选及其菌剂的研发
4. 油脂降解菌的筛选  
5. 复合微生物菌剂研发 

二、废弃物生物转化 

1. 餐厨垃圾生化一体机工艺优化 
2. 密闭移动槽式反应器开发
3. 蚯蚓处理餐厨垃圾的适应性研究
4. 餐厨有机肥对种子的发芽率以及根抑制实验
5. 外源酶在餐厨废弃物堆肥中的应用 
6. 有机垃圾渗滤液处理 

三、废弃物资源化产品及应用  

1. 餐厨垃圾二次堆肥研究 
2. 不同来源有机肥水稻田间定位试验 
3. 不同生产模式下水稻农场生物多样性及土壤质量监测 
4. 苏州市中小学食物消费与有机废弃物处理调研 
5. 不同模式下有机废弃物处理生命周期研究 
6. 镇级有机废弃物产生及处理利用现状调研 

四、其它方向  

1. 枇杷三倍体品种繁育与绿色种植  
2. 食品与环境污染物免疫检测  
3. 生态农场标准  

研究院目前已开展的研究方向和内容